CDS

Accession Number TCMCG005C18150
gbkey CDS
Protein Id XP_020264632.1
Location complement(join(101550750..101551006,101551134..101551266,101551428..101551942,101552082..101552115,101553296..101553529,101554433..101554712,101554785..101555050,101555120..101556664,101557032..101557097,101557207..101557332,101557407..101557823,101557917..101558098,101558306..101558442,101561815..101562281,101566432..101566845,101566961..101567222,101567375..101567515,101567652..101567832,101568518..101568854,101568930..101569182,101569280..101569472,101569556..101569905,101569999..101570070,101570388..101570595,101570759..101570962,101571893..101572075,101574623..101574729,101575636..101575709,101575781..101575859,101577068..101577112,101578931..101579088,101580014..101580133,101580212..101580277))
Gene LOC109840404
GeneID 109840404
Organism Asparagus officinalis

Protein

Length 2701aa
Molecule type protein
Topology linear
Data_file_division PLN
dblink BioProject:PRJNA376608;
db_source XM_020409043.1
Definition small subunit processome component 20 homolog isoform X2

EGGNOG-MAPPER Annotation

COG_category V
Description Down-regulated in metastasis
KEGG_TC -
KEGG_Module -
KEGG_Reaction -
KEGG_rclass -
BRITE ko00000        [VIEW IN KEGG]
ko03009        [VIEW IN KEGG]
KEGG_ko ko:K14772        [VIEW IN KEGG]
EC -
KEGG_Pathway -
GOs -

Sequence

CDS:  
ATGGCGACTTCAAGGTCGCAGTCCGTGAAGTGCCTGGATACTTCCTCAGGCCCAAAGCGATTCACTTTCAAGAGCATCTCCCAGAGAATCAAAGAAATCGACATCAATGTCTACAAGAGCCTCGACCCCTTGAGGTCCGAGCCCAAAAGCTCCTCCTTTTTCCTCGACAGTCTTTTGTATTGGCGAGAACTGAACACCGCGGAGGACTTCATCTCGTTTTATGAGGAGATGATGCCTTTAGTCCAGACGATGCCGCAAATTTTGTTCCACAAGGATAAAATTTTCTCCGAGCTTATCCGGAGAGTGAACATGAAAGCACAGTTGTCCCTCGAACCGATACTGATGTTAATAGCTAGTCTATCAAGAGATATCCTACAAGAGTTCTTACCGTTTCTGCAAAGGCTTACAGATTGTGTGGTCAACCTCCTCACAAATGGTGGTCGTTATAATCCAAACATCCTTGAGCAGGTCTTTACATCTTGGCAATATATAATGATGTATCTCCAAAAATACCTTGTCAAGGATGTCGTTGATGTCCTGAAGATTACAACCCGATTAAGATATTTTGAAAATGATTATGTGCCAGACTTCATGGCTGAAGCTGTCTCATTTTTGCTGAGAAACTCGTCAGCTATGGAACTTAAAAAAGGTCTGAGAATGATAGTCCTAGAAGTTGCAGAAAGTCCATCTGCAATTAAGAAGCGTGGGGCAACTGCTTTGCTGTTTTATGTTCTCAAAGGAACTTCTTCAAGACTTCACTCAAGAGCTGAGAAAGTATTTCGGTGGTTGATTGACAAATCTTTCCTCAGCCTCAGTGATGAATCCCTGGAAGGTTTGGAAGCTGTTCTTGAGGTTTCCAGTGATGTTATTAAAAGAATATTCAAGGAGCTTGACCCTACAGAGTTTGGTATGGTTTATAAATGCTTATATGAGGAAACATCCAGCTCCATAAATGATGGTTGCTTGATGCATCTTAATCGCTTGCTATCTCTTCTTACTACTACTATTTACCAGTCTAACAATACTCAAATCTATGATAGTGAAACATTGCTTGAACTTGTCAGATTGCTTATACGGTCATACATTGTGCCTGTTGAGAATATGAAGTCAGAAGAGCATTTTTCTGAAGTCCTTAATGGGATTTTAGAGTTGACGCTATGCCTTCTGGACAATCCTCTCATTTCAGACGATTTGTCAAGCATTTCTCTGGATTATGCACCTGTATTCAGGTTGAAAAATTCAGGGCTATCATTTGTTAACAGGCTTCTTCTAAAGAATCCATGTGTTGTACATGCCTTCAGACATCACATTATAAGCGCAATGGCTAATTTAATTGAAGAATCACCAGAGGTGGTCCTTTTTTCAATTATTAAGTTCATTGAAGGACAGGAAAAGCTGCAACCTTTCAATAGCCTAGCTGGAATACCATCTGAAGAAATGTTAAAATTATGCAATTATTTTAAGGAGATTCTCTTTTTTTGGGTCAAGCTTTTAGGTCGCTGTACAACAGATAACAGTCTGTCTGATGCACCAGTTACTATATCCAATATGGCTGTGCTGTGGGGAGTCCTTAGCTGCTATCCTCATTTTCAGCATTTACATGACAATGTGTCACCAATTATCGATCTAATTGTCGCTCTTGATCAAGTTCTGGAAACTGAGGCTGACAACATTGCAGGCATTCCAAAGTCTACATGGCAGAGTCTTCTTGGTGCTGCATTGATTTCTTATCATAAACTGCTATTGGTTACAAAAACAGGCCTTTCAGAAACAAGCACATTTCTGCGCCTAGCTAAGAGATACAAGTCTTCTTCACAAGTATTATTTGCCGTAGCTGAATTTTTGGATTCATTTATTGGTGGTATTTCAAAATCTGAAGCACATGCCTCCCAGAACATTCGTGATCTTGATACCAATGAAGCCGTGATCGCAACTAATATATTTTCAGATAATTTATCTCTTCCAAATAAGGAAATTCGCATGTCAACACTGAGGATTTTATCCCATTATGCTCCTTTAGGTGGACCATCGGCAACAAGTTATGAGCCCCCTCATAAGAAACTAAAAACAGAAGAATCCGGTTCATGCAGTGAACTCTCCCCAAGCAGTAATGTTGTTGACCTTCTTCTTTTGGTTGAGGCAACTCCTCTTTCAATATCTTCAAGTAGAAAAATTGTAAACCTCATTTCCAGGCTGCAGAAGGGACTCTCTTCCGCAAGAGTTAATCACGCGTACTTACCTCTTGTTTTAAATGGACTAATTGGTACATTACATAATAGATTGAGTTACCTATGGCAGCCAGCATCAGAGTGTCTGGCTGTTCTACTAGGAAGATACAAGGATCTTGTTTGGAATAAATTTGTTCAGCATTTGGAAAATTATCAGTTGAGATTTCTATCCTCGAGTGATGAGTTGGTGAAAATAAATTCAGAAAGTCCACAAGAAAAGAATCTAGTTGACTGCTTTAAACTGTTCCTGGCTCCTGATTTCGATAACACACCATGTGTGACAGTGATTAATCAATTTCTCAAGTCACTCCAAGAAGTCCATGACCTTGCAGAGTCTAGGTCTCGACAATTAATTCCATTGTTCTTGAAATTTTTGGGTTATGCTGATGATAGTCGTTCGAGTGTTGAACCATTTAGCGGCCACAGTTGTTCAGGGAAGCAGTGGAGGTTGGTCCTCAAGGAATGGTTGAACTTATTGAAATCAATGCGTGATGTTCGATCTTTATACCAAAGCCAATTTCTTAAGGAAGTTTTGTCAAACAGGCTTCTAGGTGAAATTGATTCTGATATACAATTGAAGGTTTTGGATTGTTTGCTGAACTGGAAGGATGAATTTCTAACCCCATATGGTCAGCATCTTAAAAACCTGATTATTTCAAAAAACCTTCGTGAGGAACTTGCTATATGGTCTGCTTCAAAAGATTCTCAATGTATTCAAGAGTGCCACAGGGGTCCCATGATTCCTATACTTATCCGATTGCTAACACCGAAAGTCAGGAACTTAAAAACACTTGGGTCGCGTAAGCATACAGGTGTTAGTCATCGAAGGGCAGTTCTTTGTTTCTTAGCACAACTCGATGTTGACGAGCTTCATTTATTTTTTGCTTTACTATTAAATCCCTTGCTCCGGTGTCCTCTGGCAAGTGATGTGACCAACACTCAGTTTGCTATTCCTTTTGAGAAAGATATAGAACCTCGTTCCTCAGTTCTGGTGAAATGTTCAGACACAGTGGCCCTAGGTAATTTTTCATGGAAGAAGAGTTATGGATTCTTGCATGTTGTTGAAGATATATTGAGAACTTTTGATGAATTTCACATAAGGCCGTTTCTTAACCTGTTGATGAGGGTTGTTGCTCAGATACTTGAAAGTTGCATGTTGAGCCTCACTAGTGACTCAAAAGTCCATGGTACAGATATTCCGCTGCTGTCAGCCAACATGGTGAGTACATCTAATAAGCAGTACAAGGAGTTGCGATCTTTATGCCTGAAGATCATCTCTTTTGCTCTCAATAAGTATGATAGTCATGACTTCGGTTCCGACTTTTGGGACACATTTTTCAATTCAGTGAAACCTCTAACTGACTGCTTCAAGCAGGAGGCTGCCAGTAGTGAAAAAGCAAGCTCTCTTTTTTCATGTTTTCTTGCTATGAGTAGAAGCCGAACATTAGTCTCACTTTTAGATCGGGAAGCAAAGTTGATTCCTAAGATTTTTTCAATCCTCACTGTGAGGACTGCCTCTGATGATATCATATCTTCTGTGCTTAATTTTGTTGAAAATTTGTTAATCTTGGATAATGAGTCTAATGATCAAGAGGAAAACCCTGTAAAAGGAGTCTTGTTACCTCACCTTGCAGTGCTAATTGACTGTTTTCATGGGCTTCTTCAATCCCATAAAGAGATCAGCAGGAAATCTCCCATGTCGTCTGGAAAGACAGAGCTGAGAATATTTAAACTGTTAGTGAAGTATGTAAATGATCCTGTGGTAGCAGAGAAATTTGTGGACATACTACTCCCAATTTTCAAAAAGAAAGCTTTAAATTCTGATGAGTGTTTGGATGGTTTACATATCATAAGGCAGATTCTACCCGTGCTGAGTGATAAAACAACTGGAAAAATTCTCAGTGCAGTTAATCCGCTCCTTGTTTCTTGTGGTTTGAACATGCGGTTGTGCATTTGTGATATTCTTGACGGCCTTTCTTTGATTGATCCATCTTTGGCATTTCTGGCTAGGCTTCTTCGTGAATTGAATGCTGTGTCTTATTTGGAGATAAACGAGCTTGACTATGACACAAGAATATCTGCTTATAATTCAATAAGGCCAGATATCTTCTCTTCATTCATGGAGGAACATGCTTTAACTGTACTATCTCATTGCATATATGACATGTCCTCTGAAGAACTGATTCTACGGCAAAGTGCCTCTAAGTCATTGCTGTCCTTCATACGATTTGCGGCATCAGTATTAGATAGCAATGGAGAGGAGAGGTCCCCTGGTGAATTACTTGAAGGCAAAACATACCCAATTCTTGAAATAACTAATACCAGTTTTACTTGGACGAAAGCTTGCATTCAGCGTATAGTTAAGAAAACTTTCCTGCAGAATATTGGTGATGCTATGTCCAAGGATATCTCAATGCAGAAAGAATGGATTGATCTTTTTCGAGATATGGTTAATCATCTTCATCAAATCCCAGCTTTAAACTCTTTTAGAAGTTTGTGCAGTGAGGATCCTGAAGTGGACTTTTTTAATAACATTGTTCACTTGCAGACACACAGAAGAGGAAGGGCGCTATCACGATTTAGAAGTGCAATCAGTGCTGGAAGCTTGCCAGAGAATATTACCATCAAGATATTTGTTCCTCTATTTTTCAACATGATGCTTGATGTGAAGGCCGGGAAAGGGGAGCACTTAAGAAATGCATGCTTGACAACTCTGGCTTCAATATCAGGGCAAATGCATTGGGAAAACTATCGTGTATTTTTAATGAGATGCTTCAAGGAAATAAAGTTCAAGCCAGACAAAGGGAAAATCATGATACGCCTGATATGTGAAGTGTTGGACATGTTCCACTTTTTTGGTGCCAACTCCAGTTTACATGTTAAAGACGGTAGAAAAGAGGATGTAAATAATGAGAGCACTGAAGATAATTTAAGTGTTGCATGGGTTTATTGTCCAGAATCAAATGTTCCGTTGGAAATACAAGACTGCTTGCAGAAGGTAGTCTTTCCAAAACTTACGAAGTTGCTGAAATCAGACTCTGAGAAAGTGAATGTTAACTTTAGTCTTGCTGCCTTAAAATTGCTCAAGTTGCTCCCGAAGGAAACTATGGAAGCACAACTACCAAGCATCCTTCATCGCATTTGTAACTTTTTAAAGAATCGACTAGAAAGCATACGTGATGAAGCAAGATCTGCTTTGGCTGCTTGTGCTAAGGAGTTGGGGATGGAAGGATTTTACTTGATAGTTAAGGTTTTGAAAGCAACACTAAAGAGGGGTTTTGAGTTGCATGTTTTGGGATACACCCTCAATTTCATATTATCTAAAATGCTTGAAAATTCCTCTGTTGGGAAACTCGATTATTGTTTGGAAGAGCTTCTATCGATCGCTGAAAATGACATTCTTGGACATGTTGCAGAGGAGAAAGAAGTTGGTAAAATTGCTTCAAAAATGAAAGAAACCAGGAAAAGAAAATCCTTTGAAACCCTGAAGCTGATATCGCAGAGTATTACTTTCAGGACACATGCTCGGAAGTTGCTTTCCCCCATCAAGGAACATCTTCAGAAACACCTCACGCCAGGAGCAAAGTCAAAACTTGAACAAATGCTATCTCATATTGCTCTAGGAATTGAGTGCAACCCATCTACAAAACCAGATGAATTGTTTATCTTTGTGTATGGGCTCATTGAAGATGGTATCACAGGTTCTGGTTGTCACAATGGATCTGAAAACTTAACTAATAAAACATCCATCCAAGAATTATCAGATAAAAGGAATACCTTGAGTCCCAAAAGGTCAAAGAATGATCATCTTATCATTGTTTTTGCCCTTGGAGTATTAAATAACCGTTTGAAGAATATGAAGTTGGACAAGAATGATGAGCAATTATTATCAATGTTGGATCCCTTTATTGTACTGCTTGGGAACTGCTTGAATTCCAAATATGAAGACATATTGTCTAGTGCTTTTAGATGCCTGGCTCCACTAATCAAGCTTCCTCTACCTTCCCTGGAAGCACAGGCTGATAACATCAAGATTTTACTTCTAGATATTGCTCAGAAATCTTCAAATGCTACCAATCCACTCGTACAATCTTGTCTAAAGTTGCTTACTGTTTTACTACGAAGCACTAGGATATCACTCTCACAAGATCAGCTCCACATTCTTATTCAGTTTCCTATGTTCGTTGATCTTATGGCTGACCCGTCCCCAGTTGCACTTTCACTTTTGAAGTCTATAGTTGGCCGGAAGCTGGTAGCCCATGAAATCTATGATGTTATTTTACAGGTTGCTGAAGTAATGGTAACAAGCCAGTCAGAGCCAATCCGCAGGAAATGTAGCAAAATTCTACTACAGTTCCTTCTGGATTATCAACTTTCTGATAAACGCTTGCAGCAACATATGGATTTCTTACTCACTAATCTGAATTATGAACATTCATCAGGAAGAGAATCTGTGCTTGAAATGCTTCATGCTGTTCTTATGAAATTTCCTAGAAATGTTATAGATAATCAGGCTCAGACATTCTTCCTCCATTTAGTTGTTGCTTTAGCTAATGAACGTGAGCAGAAAGTCCGATCAATGGTTTCGACTGTTATAAGAGAACTGATTGCCCGCACAAGCTCCAATGCACTAAATTTAATTTTAGATTACAGCCTTTCATGGTATATGGGTGAAAAGCAGCATCTATGGAGTGCTGCAGCACAGGTTCTGGGTTTATTGGTTGAAGTACTGAAGAAGGGATTTCAGAAACATATACCTTCTGTACTACAAGTTGCAAGAAACATTTTCACATTGTCCATTAATGCCAGCAGCATTAAAGGGTTCAACTTCTCAAACGAACCTGCAATCCCATTCTGGAAAGAGGCTTACTACTCACTTATTATGTTTGAGGCAATTTTGCTGCCCTTCCCTCAGTTGTATTTTGACAGTGACCTTGAGGATATCTGGGAAATGATTCTCAAGTTCTTGCTACATCCTCATGTATGGTTGCGGAACATTTCCAATCGGCTGGTGGCCTTAAATTTTTCAGCTGTATCGGAGGCTGGTAGGGTTATACATGACGATTTGGGCGAAGGACCTTCTTATCTTGCTAATCCAAGCAGGCTTTGTTTGATATCTGCTTCGCTTCTGAACCAGCTGAAGACACAAATCTCTGATGACGGTGCAATAATAAATATCATTACTCAGAATTTTGCATTCTCAATTTGCCATTTGCATAGTTTTACAAAAAAGAGATCTAATTTGGTTCCACATGAGTTTTGGTCTACTCTTGGTCATCGCGATCAAACTTCGTATCTGGAGGCCTTTCAATTGCTTGGATCCAGTAAGGCAAAGGACATCTTTATGCTGGCAACAATTGACACTAGTCAGGCTCCTAAGGGGGCAGATCATTCTGATGAATACAGCACTAAGAACCTTCAATCTTTGTTAGTTGCACCTTTACTCAAGAGGATGGGAAAAATCGCAATGGAAATGGAGGATATACAGATGAAGATCGTTTTTAATTGCTTCAGACTGATATCATCACAAATGGGTTCTGAAGATTGCAAAGACTATGCCTTTTACCTGCTTATTCCTCTATATAAAGCATGTGAAGGATTCATGGGCAAGATTGTTAGCGATGATATCAAACAGCTGGCAGAAGAGGTCCGAGGCAATGTAAGGGACATAATAGGGGTGGACAATTTTGTTCAAGTTTACAATGAAATCAGAAAGAAACTCAAGGGGAAGAGGGACAAGAGGAAGTATGACCAGAAGCTTCTTGCTGTTGTCAATCCTATGAGACATGCAAAGAGGAAGCTGAGACTTGCAGCTAAGCATCGTGCTCATAAGAAGAGGAAGATAACTGCCATGAAGATGATCAAATTGAGAAGATAG
Protein:  
MATSRSQSVKCLDTSSGPKRFTFKSISQRIKEIDINVYKSLDPLRSEPKSSSFFLDSLLYWRELNTAEDFISFYEEMMPLVQTMPQILFHKDKIFSELIRRVNMKAQLSLEPILMLIASLSRDILQEFLPFLQRLTDCVVNLLTNGGRYNPNILEQVFTSWQYIMMYLQKYLVKDVVDVLKITTRLRYFENDYVPDFMAEAVSFLLRNSSAMELKKGLRMIVLEVAESPSAIKKRGATALLFYVLKGTSSRLHSRAEKVFRWLIDKSFLSLSDESLEGLEAVLEVSSDVIKRIFKELDPTEFGMVYKCLYEETSSSINDGCLMHLNRLLSLLTTTIYQSNNTQIYDSETLLELVRLLIRSYIVPVENMKSEEHFSEVLNGILELTLCLLDNPLISDDLSSISLDYAPVFRLKNSGLSFVNRLLLKNPCVVHAFRHHIISAMANLIEESPEVVLFSIIKFIEGQEKLQPFNSLAGIPSEEMLKLCNYFKEILFFWVKLLGRCTTDNSLSDAPVTISNMAVLWGVLSCYPHFQHLHDNVSPIIDLIVALDQVLETEADNIAGIPKSTWQSLLGAALISYHKLLLVTKTGLSETSTFLRLAKRYKSSSQVLFAVAEFLDSFIGGISKSEAHASQNIRDLDTNEAVIATNIFSDNLSLPNKEIRMSTLRILSHYAPLGGPSATSYEPPHKKLKTEESGSCSELSPSSNVVDLLLLVEATPLSISSSRKIVNLISRLQKGLSSARVNHAYLPLVLNGLIGTLHNRLSYLWQPASECLAVLLGRYKDLVWNKFVQHLENYQLRFLSSSDELVKINSESPQEKNLVDCFKLFLAPDFDNTPCVTVINQFLKSLQEVHDLAESRSRQLIPLFLKFLGYADDSRSSVEPFSGHSCSGKQWRLVLKEWLNLLKSMRDVRSLYQSQFLKEVLSNRLLGEIDSDIQLKVLDCLLNWKDEFLTPYGQHLKNLIISKNLREELAIWSASKDSQCIQECHRGPMIPILIRLLTPKVRNLKTLGSRKHTGVSHRRAVLCFLAQLDVDELHLFFALLLNPLLRCPLASDVTNTQFAIPFEKDIEPRSSVLVKCSDTVALGNFSWKKSYGFLHVVEDILRTFDEFHIRPFLNLLMRVVAQILESCMLSLTSDSKVHGTDIPLLSANMVSTSNKQYKELRSLCLKIISFALNKYDSHDFGSDFWDTFFNSVKPLTDCFKQEAASSEKASSLFSCFLAMSRSRTLVSLLDREAKLIPKIFSILTVRTASDDIISSVLNFVENLLILDNESNDQEENPVKGVLLPHLAVLIDCFHGLLQSHKEISRKSPMSSGKTELRIFKLLVKYVNDPVVAEKFVDILLPIFKKKALNSDECLDGLHIIRQILPVLSDKTTGKILSAVNPLLVSCGLNMRLCICDILDGLSLIDPSLAFLARLLRELNAVSYLEINELDYDTRISAYNSIRPDIFSSFMEEHALTVLSHCIYDMSSEELILRQSASKSLLSFIRFAASVLDSNGEERSPGELLEGKTYPILEITNTSFTWTKACIQRIVKKTFLQNIGDAMSKDISMQKEWIDLFRDMVNHLHQIPALNSFRSLCSEDPEVDFFNNIVHLQTHRRGRALSRFRSAISAGSLPENITIKIFVPLFFNMMLDVKAGKGEHLRNACLTTLASISGQMHWENYRVFLMRCFKEIKFKPDKGKIMIRLICEVLDMFHFFGANSSLHVKDGRKEDVNNESTEDNLSVAWVYCPESNVPLEIQDCLQKVVFPKLTKLLKSDSEKVNVNFSLAALKLLKLLPKETMEAQLPSILHRICNFLKNRLESIRDEARSALAACAKELGMEGFYLIVKVLKATLKRGFELHVLGYTLNFILSKMLENSSVGKLDYCLEELLSIAENDILGHVAEEKEVGKIASKMKETRKRKSFETLKLISQSITFRTHARKLLSPIKEHLQKHLTPGAKSKLEQMLSHIALGIECNPSTKPDELFIFVYGLIEDGITGSGCHNGSENLTNKTSIQELSDKRNTLSPKRSKNDHLIIVFALGVLNNRLKNMKLDKNDEQLLSMLDPFIVLLGNCLNSKYEDILSSAFRCLAPLIKLPLPSLEAQADNIKILLLDIAQKSSNATNPLVQSCLKLLTVLLRSTRISLSQDQLHILIQFPMFVDLMADPSPVALSLLKSIVGRKLVAHEIYDVILQVAEVMVTSQSEPIRRKCSKILLQFLLDYQLSDKRLQQHMDFLLTNLNYEHSSGRESVLEMLHAVLMKFPRNVIDNQAQTFFLHLVVALANEREQKVRSMVSTVIRELIARTSSNALNLILDYSLSWYMGEKQHLWSAAAQVLGLLVEVLKKGFQKHIPSVLQVARNIFTLSINASSIKGFNFSNEPAIPFWKEAYYSLIMFEAILLPFPQLYFDSDLEDIWEMILKFLLHPHVWLRNISNRLVALNFSAVSEAGRVIHDDLGEGPSYLANPSRLCLISASLLNQLKTQISDDGAIINIITQNFAFSICHLHSFTKKRSNLVPHEFWSTLGHRDQTSYLEAFQLLGSSKAKDIFMLATIDTSQAPKGADHSDEYSTKNLQSLLVAPLLKRMGKIAMEMEDIQMKIVFNCFRLISSQMGSEDCKDYAFYLLIPLYKACEGFMGKIVSDDIKQLAEEVRGNVRDIIGVDNFVQVYNEIRKKLKGKRDKRKYDQKLLAVVNPMRHAKRKLRLAAKHRAHKKRKITAMKMIKLRR